Sekundär TCF7L2-variant
Detta är den näst mest studerade varianten i TCF7L2-genen, lokaliserad i intron 4
ungefär 50 kb från den primära varianten rs7903146. Medan rs7903146
är den primära riskvarianten för diabetes, ger rs12255372 ytterligare information
om din TCF7L2-haplotyp. De två varianterna är i måttlig kopplingsobalans| Kopplingsobalans betyder att dessa varianter tenderar att ärvas tillsammans eftersom de ligger nära varandra på samma kromosom, inom ett 92-kb LD-block, vilket innebär att de ofta nedärvs tillsammans men inte alltid.
Mekanismen
Liksom rs7903146 ligger denna variant i en icke-kodande region och tros
påverka TCF7L2-uttrycksnivåer, även om rs7903146 verkar vara den starkare
funktionella drivaren. T-allelen på denna position är associerad med minskad
insulinsekretion och försämrat inkretinsvar.
Evidensen
En metaanalys av 28 studier | Wang et al. Association of rs12255372 in the TCF7L2 gene with type 2 diabetes mellitus: a meta-analysis. Braz J Med Biol Res, 2013 bekräftade sambandet med
typ 2-diabetes med en oddskvot på 1,39 (95 % CI: 1,35-1,42). Effekten är
konsekvent i europeiska, afrikanska och sydasiatiska populationer men svagare i
östasiatiska populationer där T-allelen är sällsynt (~2 % frekvens).
Studien Pounds Lost | Mattei et al. Am J Clin Nutr, 2012 undersökte också
rs12255372 och fann att bärare av T-allelen som åt en kost med lägre fettinnehåll hade
större minskningar i kroppsfett, vilket kan förbättra glykemisk kontroll.
Praktiska konsekvenser
Att ha riskalleler vid både rs7903146 och rs12255372 förstärker din totala
TCF7L2-relaterade diabetesrisk. Kostrekommendationerna är desamma:
måttligt fettintag och ett kostmönster i medelhavsstil.
Interaktioner
Denna variant är i måttlig kopplingsobalans med rs7903146. Om du bär
riskalleler på båda positionerna är din totala TCF7L2-relaterade risk högre.
Alla genotyper
Normal vid denna position
Du bär inte riskvarianten vid denna sekundära position i TCF7L2. Cirka 60 % av personer med europeiskt ursprung delar denna genotyp. Din diabetesrisk från just denna specifika variant är inte förhöjd.
En riskallel vid sekundär position i TCF7L2
Du bär en riskallel vid denna sekundära position i TCF7L2. Cirka 34 % av européer delar denna genotyp. Detta ökar diabetesrisken något, särskilt i kombination med den primära varianten rs7903146.
Två riskalleler vid sekundär position
Du har två riskalleler vid denna position, vilket bidrar till den övergripande TCF7L2-relaterade diabetesrisken. Cirka 6 % av européer delar denna genotyp. Detta är särskilt betydelsefullt om du också bär T-allelen vid rs7903146.