← Utforska varianter

TNF -308 G>A

rs1800629

TNF-308: Inflammationsförstärkaren

TNF-genen kodar för tumor necrosis factor-alpha | en huvudregulator av inflammation och immunsvar, som produceras av makrofager, T-celler och andra immunceller. Denna -308 G>A-variant sitter i promotorregionen | den DNA-sekvens som styr hur mycket TNF-alpha som produceras i genen på kromosom 6p21.3, inom det stora histokompatibilitetskomplexet. A-allelen stör bindningsställen för transkriptionsfaktorer och ökar TNF-alpha-produktionen ungefär 2-faldigt jämfört med G-allelen när immunceller stimuleras.

Mekanismen

Detta är en regulatorisk variant som påverkar gentranskription | hur mycket protein som produceras från genen. Positionen -308 ligger 308 baspar uppströms från där TNF-genen börjar kopieras till RNA. A-allelen förändrar bindningsställen för nukleära transkriptionsfaktorer, vilket leder till ökad transkriptionell aktivitet i immunceller. När ditt immunsystem möter ett hot producerar bärare av A-allelen väsentligt mer TNF-alpha än GG-bärare, vilket förstärker det inflammatoriska svaret.

Evidensen

En metaanalys av 1,774 kontroller och 1,147 fall av celiaki fann att A-allelen medför en 2-faldigt ökad risk (OR 2.051)
, där

AA-homozygoter visade 6.6-faldigt ökad risk (OR 6.626)
.

A-allelen leder till ungefär 2-faldigt högre TNF-alpha-transkription vid stimulering av immunceller
, och
bärare visar signifikant högre TNF-alpha-nivåer i serum
.

Varianten förutsäger också svar på anti-TNF biologic drugs | läkemedel som infliximab och etanercept som blockerar TNF-alpha som används för att behandla reumatoid artrit och inflammatorisk tarmsjukdom.

RA-patienter med GG-genotypen svarar bättre på etanercept, medan AA-genotypen signifikant minskar behandlingssvaret
.

Samma mönster gäller för etanercept — GG visar bättre svar än AA eller AG
.

Associationer har rapporterats med flera autoimmuna tillstånd.

Hos patienter med reumatoid artrit visar bärare av A-allelen högre risk för kardiovaskulära händelser (HR 1.72), särskilt hos dem som också bär den reumatoida shared epitope
. Studier kopplar varianten till ökad risk för vitiligo, preeklampsi i asiatiska och kaukasiska populationer samt aggressiv parodontit.

Praktiska implikationer

Om du har en autoimmun sjukdom, särskilt reumatoid artrit eller inflammatorisk tarmsjukdom, kan din -308-genotyp påverka hur väl du svarar på biologiska anti-TNF-läkemedel. GG-bärare tenderar att svara bättre på anti-TNF-läkemedel som etanercept (Enbrel), medan bärare av A-allelen kan behöva alternativa mekanismer. Om du är bärare av A-allelen och inte svarar väl på ett anti-TNF-läkemedel kan byte till en annan verkningsmekanism (som IL-6-hämmare eller JAK-hämmare) vara mer effektivt än att prova ett annat anti-TNF-läkemedel.

För personer med en eller två A-alleler orsakar A-allelen inte inflammation i sig — den förstärker kroppens inflammatoriska svar när det utlöses. Det betyder att kända inflammatoriska triggers kan framkalla starkare svar hos bärare av A-allelen, och autoimmuna skov kan vara mer intensiva.

Interaktioner

TNF-308-varianten ligger inom ett kluster av relaterade TNF-polymorfismer inklusive rs361525 | TNF-238 G>A, en annan promotorvariant och rs1799724 | TNF-857 C>T. Dessa varianter är i kopplingsobalans, vilket betyder att de ofta ärvs tillsammans. Samverkande effekter med andra gener i inflammatoriska signalvägar (IL-6, IL-10, IL-1) har dokumenterats, särskilt för att förutsäga svar på anti-TNF-läkemedel.

Alla genotyper

GG normal

Standardinflammatoriskt svar och god respons på anti-TNF-läkemedel

Du har två kopior av den vanliga G-allelen. Dina celler producerar normala mängder TNF-alpha när ditt immunsystem aktiveras. Cirka 74 % av människor har denna genotyp. Om du utvecklar ett autoimmunt tillstånd som kräver biologisk anti-TNF-behandling tyder forskning på att du sannolikt svarar bra på dessa läkemedel.

AG intermediate

Måttligt ökad TNF-alpha-produktion och intermediärt läkemedelssvar

Du har en kopia av A-allelen och en G-allel. Dina immunceller producerar måttligt förhöjda nivåer av TNF-alpha vid stimulering—ungefär 1,5–2 gånger högre än hos GG-bärare. Cirka 24 % av befolkningen har denna genotyp. Detta skapar ett lätt förstärkt inflammatoriskt svar och kan påverka ditt svar på anti-TNF-läkemedel om du behöver dem för autoimmun sjukdom.

AA high

Betydligt förhöjd TNF-alpha-produktion och reducerat svar på anti-TNF-läkemedel

Du har två kopior av A-allelen. Dina immunceller producerar 2–3 gånger högre nivåer av TNF-alpha vid stimulering jämfört med GG-bärare. Cirka 2 % av befolkningen bär denna genotyp. Detta förstärker ditt inflammatoriska svar avsevärt och är associerat med ökad risk för flera autoimmuna tillstånd. Om du behöver biologisk anti-TNF-behandling är sannolikheten betydligt lägre att du svarar väl på dessa läkemedel.